Carlo Bonini lavora come inviato speciale del quotidiano «la Repubblica», dove è arrivato dopo aver lavorato per «il Manifesto» e «il Corriere della sera».
Ha pubblicato per Tropea La toga rossa e Il fiore del male.
Tra le sue pubblicazioni più importanti ricordiamo il reportage narrativo Guantánamo, Il mercato della paura (Einaudi, 2006) con Giuseppe D'Avanzo, e Acab. All Cops Are Bastards (Einaudi, 2009). Nel 2013 sempre per la casa editrice torinese esce Suburra, di cui è autore insieme a Giancarlo De Cataldo; e nel 2014 viene pubblicato I semi del male per Rizzoli, frutto della collaborazione tra lo stesso Bonini e De Cataldo, Dazieri, Fois, Morchio e Pandiani. Nel 2016 scrive con Giancarlo De Cataldo La notte di Roma (Einaudi). Del 2018 è invece L'isola assassina, pubblicato con Feltrinelli, un'inchiesta sulla giornalista maltese Daphne Caruana Galizia, uccisa nel 2017. Con Giuliano Foschini ha scritto Ti mangio il cuore (Feltrinelli, 2019).